Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
PrcdQ00LT2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms