Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Rbp4Q00724 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms