Protein–RNA interactions for Protein: Q00623

Apoa1, Apolipoprotein A-I, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa1Q00623 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Apoa1Q00623 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Apoa1Q00623 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms