Protein–RNA interactions for Protein: Q00422

Gabpa, GA-binding protein alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabpaQ00422 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GabpaQ00422 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GabpaQ00422 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms