Protein–RNA interactions for Protein: P97929

Brca2, Breast cancer type 2 susceptibility protein homolog, mousemouse

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Length 3,329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brca2P97929 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Brca2P97929 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Brca2P97929 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Brca2P97929 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Brca2P97929 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Brca2P97929 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Brca2P97929 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms