Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
rp9P97762 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
rp9P97762 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
rp9P97762 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
rp9P97762 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
rp9P97762 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
rp9P97762 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
rp9P97762 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
rp9P97762 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
rp9P97762 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
rp9P97762 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
rp9P97762 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
rp9P97762 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
rp9P97762 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
rp9P97762 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
rp9P97762 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
rp9P97762 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
rp9P97762 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
rp9P97762 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
rp9P97762 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
rp9P97762 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
rp9P97762 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
rp9P97762 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms