Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nbr1P97432 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Nbr1P97432 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms