Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhodP97348 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhodP97348 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhodP97348 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhodP97348 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhodP97348 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhodP97348 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhodP97348 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhodP97348 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhodP97348 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhodP97348 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhodP97348 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhodP97348 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhodP97348 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhodP97348 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhodP97348 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhodP97348 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhodP97348 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhodP97348 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
RhodP97348 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
RhodP97348 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
RhodP97348 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RhodP97348 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RhodP97348 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RhodP97348 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RhodP97348 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RhodP97348 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RhodP97348 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RhodP97348 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RhodP97348 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RhodP97348 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
RhodP97348 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
RhodP97348 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms