Protein–RNA interactions for Protein: P97309

Mesp1, Mesoderm posterior protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp1P97309 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Mesp1P97309 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms