Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Trim43bP86448 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms