Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Irx1P81068 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Irx1P81068 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Irx1P81068 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Irx1P81068 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx1P81068 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx1P81068 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx1P81068 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Irx1P81068 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irx1P81068 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Irx1P81068 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Irx1P81068 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx1P81068 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx1P81068 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Irx1P81068 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Irx1P81068 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Irx1P81068 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx1P81068 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx1P81068 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx1P81068 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx1P81068 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx1P81068 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Irx1P81068 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx1P81068 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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Irx1P81068 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Irx1P81068 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx1P81068 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Irx1P81068 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Irx1P81068 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Irx1P81068 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Irx1P81068 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Irx1P81068 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Irx1P81068 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Irx1P81068 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Irx1P81068 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Irx1P81068 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Irx1P81068 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Irx1P81068 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Irx1P81068 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
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