Protein–RNA interactions for Protein: P79621

Ciita, MHC class II transactivator, mousemouse

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Length 1,155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiitaP79621 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CiitaP79621 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CiitaP79621 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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