Protein–RNA interactions for Protein: P70671

Irf3, Interferon regulatory factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf3P70671 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Irf3P70671 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 804.2 ms