Protein–RNA interactions for Protein: P70658

Cxcr4, C-X-C chemokine receptor type 4, mousemouse

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr4P70658 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cxcr4P70658 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cxcr4P70658 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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