Protein–RNA interactions for Protein: P70398

Usp9x, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9xP70398 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Usp9xP70398 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
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