Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Msx3P70354 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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