Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Vamp7P70280 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vamp7P70280 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms