Protein–RNA interactions for Protein: P70257

Nfix, Nuclear factor 1 X-type, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfixP70257 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NfixP70257 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfixP70257 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfixP70257 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfixP70257 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfixP70257 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfixP70257 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfixP70257 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfixP70257 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfixP70257 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfixP70257 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NfixP70257 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NfixP70257 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfixP70257 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NfixP70257 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfixP70257 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfixP70257 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfixP70257 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfixP70257 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfixP70257 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
NfixP70257 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfixP70257 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfixP70257 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfixP70257 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfixP70257 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NfixP70257 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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NfixP70257 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfixP70257 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfixP70257 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfixP70257 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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NfixP70257 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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NfixP70257 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfixP70257 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfixP70257 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfixP70257 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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NfixP70257 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfixP70257 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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NfixP70257 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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NfixP70257 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfixP70257 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfixP70257 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfixP70257 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfixP70257 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfixP70257 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfixP70257 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NfixP70257 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfixP70257 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfixP70257 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfixP70257 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfixP70257 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfixP70257 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfixP70257 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfixP70257 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfixP70257 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfixP70257 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfixP70257 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfixP70257 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NfixP70257 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfixP70257 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfixP70257 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NfixP70257 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms