Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hoxd13P70217 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hoxd13P70217 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Hoxd13P70217 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Hoxd13P70217 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Hoxd13P70217 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Hoxd13P70217 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hoxd13P70217 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Hoxd13P70217 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Hoxd13P70217 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hoxd13P70217 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Hoxd13P70217 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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