Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Traf5P70191 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Traf5P70191 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms