Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Gnb1P62874 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms