Protein–RNA interactions for Protein: P62717

Rpl18a, 60S ribosomal protein L18a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl18aP62717 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.86
Rpl18aP62717 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.65□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
Rpl18aP62717 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms