Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp46P62069 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp46P62069 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp46P62069 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp46P62069 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp46P62069 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp46P62069 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp46P62069 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp46P62069 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Usp46P62069 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp46P62069 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Usp46P62069 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp46P62069 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Usp46P62069 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp46P62069 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp46P62069 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Usp46P62069 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp46P62069 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp46P62069 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp46P62069 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp46P62069 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp46P62069 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp46P62069 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp46P62069 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp46P62069 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp46P62069 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp46P62069 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp46P62069 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp46P62069 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Usp46P62069 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp46P62069 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp46P62069 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp46P62069 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp46P62069 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp46P62069 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp46P62069 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp46P62069 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp46P62069 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp46P62069 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Usp46P62069 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp46P62069 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp46P62069 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Usp46P62069 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Gm20618-202ENSMUST00000177482 1227 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 AC125117.2-201ENSMUST00000228344 1140 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Usp46P62069 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp46P62069 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp46P62069 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp46P62069 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp46P62069 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp46P62069 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp46P62069 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp46P62069 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp46P62069 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp46P62069 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp46P62069 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp46P62069 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp46P62069 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp46P62069 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp46P62069 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp46P62069 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp46P62069 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp46P62069 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp46P62069 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp46P62069 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp46P62069 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Usp46P62069 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Usp46P62069 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp46P62069 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp46P62069 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Usp46P62069 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms