Protein–RNA interactions for Protein: P61969

Lmo4, LIM domain transcription factor LMO4, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo4P61969 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Lmo4P61969 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms