Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Polr2iP60898 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms