Protein–RNA interactions for Protein: P59222

Scarf2, Scavenger receptor class F member 2, mousemouse

Predictions only

Length 833 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf2P59222 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Scarf2P59222 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scarf2P59222 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms