Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dpf3P58269 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Dpf3P58269 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms