Protein–RNA interactions for Protein: P57080

Usp25, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 25, mousemouse

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp25P57080 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Usp25P57080 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp25P57080 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp25P57080 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Usp25P57080 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Usp25P57080 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp25P57080 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp25P57080 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Usp25P57080 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms