Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TdgP56581 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TdgP56581 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdgP56581 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdgP56581 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdgP56581 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdgP56581 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdgP56581 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdgP56581 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdgP56581 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdgP56581 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdgP56581 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdgP56581 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TdgP56581 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TdgP56581 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TdgP56581 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TdgP56581 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TdgP56581 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TdgP56581 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TdgP56581 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TdgP56581 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TdgP56581 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TdgP56581 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TdgP56581 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TdgP56581 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TdgP56581 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TdgP56581 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TdgP56581 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TdgP56581 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TdgP56581 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TdgP56581 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TdgP56581 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TdgP56581 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TdgP56581 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TdgP56581 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TdgP56581 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TdgP56581 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TdgP56581 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
TdgP56581 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TdgP56581 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TdgP56581 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TdgP56581 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TdgP56581 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TdgP56581 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TdgP56581 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TdgP56581 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms