Protein–RNA interactions for Protein: P55041

Gem, GTP-binding protein GEM, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GemP55041 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
GemP55041 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
GemP55041 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
GemP55041 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
GemP55041 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GemP55041 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
GemP55041 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms