Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rad23aP54726 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms