Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PctpP53808 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PctpP53808 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PctpP53808 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PctpP53808 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PctpP53808 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PctpP53808 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PctpP53808 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PctpP53808 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PctpP53808 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PctpP53808 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PctpP53808 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PctpP53808 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PctpP53808 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PctpP53808 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PctpP53808 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PctpP53808 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PctpP53808 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PctpP53808 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PctpP53808 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PctpP53808 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PctpP53808 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PctpP53808 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PctpP53808 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PctpP53808 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PctpP53808 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PctpP53808 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PctpP53808 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms