Protein–RNA interactions for Protein: P53612

Rabggtb, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtbP53612 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RabggtbP53612 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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