Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ube2e3P52483 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms