Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
FmodP50608 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
FmodP50608 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
FmodP50608 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
FmodP50608 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
FmodP50608 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
FmodP50608 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
FmodP50608 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms