Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Nkx2-1P50220 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms