Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxc13P50207 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms