Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CitP49025 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CitP49025 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CitP49025 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CitP49025 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CitP49025 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CitP49025 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CitP49025 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CitP49025 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CitP49025 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CitP49025 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CitP49025 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CitP49025 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CitP49025 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CitP49025 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CitP49025 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CitP49025 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CitP49025 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CitP49025 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CitP49025 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CitP49025 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CitP49025 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CitP49025 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CitP49025 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CitP49025 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CitP49025 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CitP49025 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CitP49025 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CitP49025 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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CitP49025 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CitP49025 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CitP49025 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CitP49025 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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CitP49025 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CitP49025 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CitP49025 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CitP49025 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CitP49025 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CitP49025 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CitP49025 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CitP49025 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CitP49025 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CitP49025 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CitP49025 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CitP49025 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CitP49025 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CitP49025 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CitP49025 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CitP49025 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CitP49025 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CitP49025 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CitP49025 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CitP49025 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CitP49025 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CitP49025 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CitP49025 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CitP49025 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CitP49025 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CitP49025 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CitP49025 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CitP49025 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CitP49025 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CitP49025 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CitP49025 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CitP49025 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CitP49025 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CitP49025 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CitP49025 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CitP49025 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CitP49025 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CitP49025 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CitP49025 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CitP49025 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CitP49025 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CitP49025 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CitP49025 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CitP49025 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CitP49025 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CitP49025 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CitP49025 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CitP49025 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CitP49025 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CitP49025 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CitP49025 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CitP49025 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CitP49025 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CitP49025 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CitP49025 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms