Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tnni3P48787 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms