Protein–RNA interactions for Protein: P48379

Rfx2, DNA-binding protein RFX2, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfx2P48379 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx2P48379 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rfx2P48379 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rfx2P48379 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rfx2P48379 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx2P48379 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx2P48379 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx2P48379 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx2P48379 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Rfx2P48379 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx2P48379 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx2P48379 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx2P48379 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx2P48379 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx2P48379 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx2P48379 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx2P48379 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx2P48379 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx2P48379 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Rfx2P48379 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Rfx2P48379 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Rfx2P48379 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx2P48379 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx2P48379 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx2P48379 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx2P48379 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx2P48379 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx2P48379 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx2P48379 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx2P48379 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rfx2P48379 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx2P48379 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx2P48379 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx2P48379 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Rfx2P48379 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rfx2P48379 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Rfx2P48379 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms