Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
PtgfrP43117 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms