Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TfamP40630 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TfamP40630 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TfamP40630 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TfamP40630 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
TfamP40630 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TfamP40630 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TfamP40630 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TfamP40630 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TfamP40630 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TfamP40630 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TfamP40630 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TfamP40630 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TfamP40630 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TfamP40630 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
TfamP40630 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TfamP40630 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TfamP40630 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TfamP40630 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
TfamP40630 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
TfamP40630 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
TfamP40630 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
TfamP40630 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TfamP40630 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TfamP40630 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TfamP40630 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TfamP40630 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TfamP40630 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TfamP40630 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TfamP40630 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TfamP40630 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TfamP40630 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TfamP40630 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
TfamP40630 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
TfamP40630 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms