Protein–RNA interactions for Protein: P40224

Cxcl12, Stromal cell-derived factor 1, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl12P40224 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Gm21038-201ENSMUST00000222205 1383 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cxcl12P40224 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cxcl12P40224 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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