Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rfc1P35601 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms