Protein–RNA interactions for Protein: P35343

Cxcr2, C-X-C chemokine receptor type 2, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr2P35343 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr2P35343 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr2P35343 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr2P35343 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr2P35343 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr2P35343 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr2P35343 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr2P35343 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr2P35343 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr2P35343 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr2P35343 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr2P35343 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr2P35343 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr2P35343 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr2P35343 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cxcr2P35343 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cxcr2P35343 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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