Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Olfr293-201ENSMUST00000081474 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola2P33611 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Pola2P33611 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms