Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hoxc10P31257 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Hoxc10P31257 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms