Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
VtnP29788 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
VtnP29788 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
VtnP29788 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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