Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprmP28828 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprmP28828 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprmP28828 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprmP28828 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PtprmP28828 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
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