Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RxraP28700 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RxraP28700 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RxraP28700 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RxraP28700 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RxraP28700 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
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